DNASU質(zhì)粒庫可以減輕個體實驗室存儲和維護質(zhì)粒數(shù)據(jù)和樣品的負擔,并將這些質(zhì)粒分發(fā)給世界各地的研究人員。DNASU目前擁有越來越多的200,000多種質(zhì)粒,其中包含來自600多種生物的基因,其中包括在LaBaer實驗室中創(chuàng)建的克隆以及來自外部研究人員的各種克隆。我們還有兩個重要的合作。作為ORFeome Collaboration的創(chuàng)始成員,我們參與創(chuàng)建了數(shù)千種人類和小鼠基因,并且是ORFeome Collaboration質(zhì)粒和質(zhì)粒集合的關(guān)鍵分析者。自2006年起,作為PSI:Biology-Materials Repository,我們對NIGMS資助的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)倡議(PSI)研究人員創(chuàng)建的數(shù)萬個表達就緒克隆進行了序列驗證和分發(fā)。
進入我們實驗室的每個樣品都經(jīng)過序列驗證,每個質(zhì)粒的注釋都存儲在基于Oracle的數(shù)據(jù)庫中。樣品存儲在先進的Brooks BioStore冷凍儲存和回收系統(tǒng)(由NIGMS ARRA資助資助)中,使我們能夠分離質(zhì)粒并快速檢索所需的質(zhì)粒。通過本網(wǎng)站可以搜索質(zhì)粒信息,點擊克隆ID或載體名稱即可找到有關(guān)每種質(zhì)粒的更多信息。我們通過我們的網(wǎng)站向超過550個實驗室分發(fā)了200,000多種質(zhì)粒,從而使研究人員能夠?qū)ι飳W和疾病中基因和蛋白質(zhì)的功能作用進行盡可能廣泛的實驗。
除了分發(fā)材料外,MR還尋求簡化MTA流程,以減少機構(gòu)存放或接收質(zhì)粒所需的時間。為了實現(xiàn)這一目標,MR開創(chuàng)了兩個文件,即存款人的協(xié)議,其中規(guī)定了使MR能夠從外部機構(gòu)分發(fā)存放的質(zhì)粒的條款,以及加速的過程MTA,這使得研究人員無需等待其機構(gòu)簽署MTA。未來,MR將繼續(xù)為研究人員提供PSI質(zhì)粒和數(shù)據(jù),并將擴展其加速的MTA網(wǎng)絡(luò),以便研究人員能夠毫不拖延地接收PSI質(zhì)粒。
該蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)計劃的(PSI)的主要科學任務是使大多數(shù)蛋白質(zhì)的三維原子水平結(jié)構(gòu),很容易從它們對應的DNA序列的知識獲得。迄今為止,已有超過5,100種蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)被28個當前和3個前大型結(jié)構(gòu)基因組學中心確定為NIGMS資助的PSI項目的一部分。2010年夏季開始的PSI下一階段PSI:生物學的目標是繼續(xù)解決蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)并將高通量結(jié)構(gòu)生物學應用于重要的生物學問題,其中包括鼓勵結(jié)構(gòu)生物學家和研究人員之間建立伙伴關(guān)系。生物,生物化學和/或分子社區(qū)
為了表達,純化,結(jié)晶和解決這些蛋白質(zhì)家族和生物靶標的結(jié)構(gòu),已經(jīng)產(chǎn)生了超過100,000個含有從宿主生物體獲得的基因組DNA克隆的基因的質(zhì)??寺?。這些克隆中的許多對研究人員特別有價值,因為我們已經(jīng)測試并記錄了它們產(chǎn)生蛋白質(zhì)的能力,包括蛋白質(zhì)是否可溶并且可以被純化。所有這些信息都可以通過DNASU捕獲和搜索。通過單擊CloneID并鏈接到PSI Structural Biology Knowledgebase和Protein Data Bank,也可以找到有關(guān)每個克隆的其他生物學和結(jié)構(gòu)信息。
該蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)計劃,材料倉庫(PSI-MR),現(xiàn)在PSI:生物基材料庫,于2006年與存儲,維護和發(fā)布所有PSI的研究人員創(chuàng)造了超過10萬個克隆的任務創(chuàng)建。此外,每個克隆在進行分發(fā)之前都經(jīng)過序列驗證,確保發(fā)送給研究人員的克隆是正確的。截至2014年2月,超過82,000個PSI質(zhì)??晒┓职l(fā)。
DNASU產(chǎn)品介紹
物/收藏品名稱 | 向量 | 集合中的克隆數(shù)量 | 學術(shù)/非營利機構(gòu) | 所有其他 研究員 |
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90/90人類ORFeome V1 - 完整系列 | 90/90人類ORFeome V 1(網(wǎng)關(guān)入口矢量) - 完整集合 | 1,1368 | $ 28420 | $ 39788 |
90/90人類ORFeome V 1(網(wǎng)關(guān)表達載體:pANT7 cGST) - 完整集合 | 10,853 | $ 27132.50 | $ 37985.50 | |
90/90人類ORFeome V1 - 膜蛋白 | 90/90人類ORFeome V 1(網(wǎng)關(guān)進入載體) - 膜蛋白質(zhì)子收集 | 4187 | $ 10467.50 | $ 14654.50 |
90/90人ORFeome V 1(Gateway表達載體:pANT7 cGST) - 膜蛋白Sub集合 | 10,853 | $ 27132.50 | $ 37985.50 | |
90/90人類ORFeome V1 - 轉(zhuǎn)錄因子 | 90/90人類ORFeome V 1(網(wǎng)關(guān)條目向量) - 轉(zhuǎn)錄因子子集 | 1500 | $ 3750 | $ 5250 |
90/90人ORFeome V 1(Gateway表達載體:pANT7 cGST) - 轉(zhuǎn)錄因子Sub集合 | 1342 | $ 3355 | $ 4697 | |
90/90人類ORFeome V1 - 其他ORFs | 90/90人類ORFeome V 1(網(wǎng)關(guān)條目向量) - 其他ORFs子集 | 5,682 | $ 14205 | $ 19887 |
90/90人類ORFeome V 1(網(wǎng)關(guān)表達載體:pANT7 cGST) - 其他子集合 | 5605 | $ 14012.50 | $ 19617.50 | |
1000個與人乳腺癌相關(guān)的基因組 | pDNR-Dual,C端子標簽 | 1155 | $ 2887.50 | $ 4042.50 |
pDNR-Dual,全套 | 2,201 | $ 5502.50 | $ 7703.5 | |
pDNR-Dual,無標記 | 1046 | $ 2615 | $ 3661 | |
人類激酶集合 | pDNR雙,全套 | 632 | $ 1580年 | $器2212 |
pDNR雙C端子標簽 | 543 | $ 1357.5 | $ 1900.50 | |
pJP1520逆轉(zhuǎn)錄病毒載體 | 651 | $ 1627.50 | $ 2278.50 | |
pJP1563逆轉(zhuǎn)錄病毒載體 | 636 | $ 1590年 | $ 2226 | |
人類轉(zhuǎn)錄因子的收集 | pLenti6.2 / V5-DEST慢病毒載體 | 981 | $ 2452.50 | $ 3433.50 |
人類ORFeome V8.1 | pENTR223網(wǎng)關(guān)入門載體質(zhì)粒集合 | 12791 | $ 31977.50 | $ 44768.50 |
pLX304 lentivrial表達集合 | 13,242 | $ 33105 | $ 46347 | |
人類表達克隆集合 | pANT_cGST無細胞表達與C末端GST標簽 | 12326 | $ 30815 | $ 43141 |
具有Flag標簽的pLDNT7_nFLAG無細胞表達載體 | 2123 | $ 5307.50 | $ 7430.50 | |
使用GST和Flag標記的載體完成收集 | 2688 | $ 6720 | $ 9408 | |
炭疽桿菌 | pANT_cGST無細胞表達與C末端GST標簽 | 4,708 | $ 11770 | $ 16478 |
pDONR221載體 | 5341 | $ 13352.5 | $ 18693.50 | |
Francisella tularensis | pDEST17大腸桿菌表達載體 | 1464 | $器3660 | $ 5124這兩款 |
pDONR221載體 | 1507 | $ 3767.50 | $ 5274.50 | |
pBY011_GFP-NH3_CN帶標簽的酵母表達載體 | 1333 | $ 3332.50 | $ 4665.50 | |
銅綠假單胞菌 | pDONR201載體 | 2383 | $ 5957.50 | $ 8340.50 |
釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | ZM552表達載體 | 5092 | $ 12730 | $ 17822 |
pBY011表達載體 | 5529 | $ 13837.50 | $ 19372.50 | |
pDONR201或221載體 | 5,333 | $ 13332.50 | $ 18665.50 | |
霍亂弧菌 | pANT_cGST無細胞表達與C末端GST標簽 | 3,310 | $ 8275 | $ 11585 |
pDONR221載體 | 3,777 | $ 9442.50 | $ 13219.50 | |
鼠疫耶爾森氏菌 | pDONR221載體 | 3,968 | $ 9920 | $ 13888 |
耶爾森氏菌假結(jié)核 | pDONR221載體 | 271 | $ 677.50 | $ 948.50 |
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