Endo F Multi-Kit將在天然和變性條件下將N-連接的聚糖脫糖基化。每種酶對N-連接的聚糖釋放具有不同的特異性??梢赃x擇組合使用這三種酶以*去除糖蛋白或肽上存在的所有N-連接的聚糖,或者獨(dú)立使用每種酶,從而確定存在的N-聚糖的類型。
qa-bio Endo F Multi-Kit說明書
KE-EFX3
推薦使用Endo F Multi-kit對由于在蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)中的聚糖位置而在非變性條件下對PNgase F裂解具有抗性的天然蛋白質(zhì)進(jìn)行去糖基化處理,因?yàn)橐阎@些酶對蛋白質(zhì)構(gòu)象的敏感性較低。
每一種酶的具有不同的N-連接的聚糖的特異性:
內(nèi)切糖苷酶F1斷裂這樣的高甘露糖和某些雜合型N-聚糖
內(nèi)切糖苷酶F2釋放雙觸角和高甘露糖聚糖(以40X減小的速率)
內(nèi)切糖苷酶F3將釋放triantennarry和巖藻糖基雙觸角N-聚糖
應(yīng)用:
–抗PNGase F切割的天然蛋白質(zhì)的去糖基化–
聚糖類型的測定(高甘露糖,雙觸角,三/四臂觸角)
–脫糖基化時通常會沉淀的脫糖基化蛋白
– X射線晶體學(xué)
這三種酶在寡糖的核心中的兩個GlcNAc殘基之間裂解天冬酰胺連接的(N-連接的)寡糖,生成截短的糖分子,其中一個N-乙酰氨基葡糖殘基保留在天冬酰胺上,增強(qiáng)了蛋白質(zhì)的溶解性。相反,PNGase F可以完整清除寡糖。
1.向Eppendorf管中加入多達(dá)200μg糖蛋白。用去離子水將最終體積調(diào)整為34μl。
2.加入10μlEndo F2 / F3 5x反應(yīng)緩沖液,250 mM乙酸鈉pH 4.5。如果單獨(dú)使用Endo F1酶,請使用Endo F1緩沖液,250 mM磷酸鈉pH 5.5。
4.將2.0μl每種酶添加到反應(yīng)中。在37°C下孵育3小時。
通過SDS-PAGE監(jiān)控切割。
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